Несмотря на то, что многие подобные памятники в целях сохранения укрываются специальными защитными сооружениями (например Чатал-Хююк в Турции), Каменная могила, как и раньше, находится под открытым небом. Практически не проводится никаких работ по её сохранению. Вместе с этим многие археологи в течение 20 столетия указывали на постепенное размывание петроглифов. Изучение большинства плит сейчас проходит по фотографиям, зарисовкам и гипсовым слепкам, сделанным ещё в сороковые — пятидесятые годы. Сейчас тех иероглифов уже нет. В сентябре 2008 года согласно указу Президента Украины № 815/2008 заповеднику был присвоен статус национального. С тех пор его официальное название — Национальный историко-археологический заповедник Каменная Могила.
Геологическая редкость формирований такого типа, как Каменная могила, послужила причиной распространения идеи об искусственном происхождении памятника. В народе ходит несколько легенд о происхождении этого места. Одна из них рассказывает о ссоре двух богатырей, которые швыряли друг в друга камни, имеет славянское происхождение. Другая записана от ногайцев:
"…Провинился как-то богатырь Богур перед аллахом, и тот покарал богатыря: приказал вырвать руками из ближнего горного кряжа камни и построить из них на берегу Молочной такой высоты гору, откуда во все стороны просматривалась бы степь. Выполняя веление аллаха, Богур рвал из кряжа громадные камни, переносил их на себе и складывал друг на друга в указанном аллахом месте. Для скорейшего исполнения работы он решил схитрить: неплотно складывал камни. Когда более чем наполовину все было уже закончено, Богур, поднимая глыбу, оступился и упал в умышленно оставленную им между камнями щель, застрял там и умер от голода. Такое наказание постигло его за попытку обмануть аллаха. Позже аллах приказал ветру засыпать песком все щели между камнями и спрятать тело богатыря Богура, кости которого и сейчас находят между камней; место это назвали Камень-горой…"